Restricted cubic spline(RCS):限制性立方样条 2021-06-25 | bioinformation | 当我们的自变量和因变量之间不是简单的线性关系,我们还可以通过多项式回归,多元线性回归等方法构造非线性的关系模型,限制性立方样条(RCS)也是 »
MetaStat原理 2021-06-01 | bioinformation | 一直不清楚MetaStat的脚本输入到底应该是Read数还是相对丰度,大概过了一下R语言版本的MetaStat代码的脚本,留此记录。 代码解析 »
Centos7 中各种国内源的配置 2020-08-23 | Linux | 由于国内网络环境的原因,CentOS7 下各种软件更新、安装速度可能会非常非常非常慢,好在一般都有国内的镜像源可以替代,这里记录我常用的各种源 »
如何将表格文件转为 sqlite3 数据库文件 2020-08-18 | Others | 平时工作中碰到的需求,需要将 tsv/csv 文件转为 sqlite3 数据库文件,本来一直想用 python 的数据库接口来实现这一目的,但经在网上的搜索,发现直接使用 sqlite3 的点命令更为方 »
HUGO 备忘 2020-08-17 | Others | 这是一个 HUGO 使用的备忘 常用命令 新建文章 hugo new post/file_name.md 如要发布,记得修改 draft 为 true 在本地查看 hugo serve -D 建立静态网页 1 2 3 4 # 不编译 draft 为 true 的文章 hugo # 编译 draft 为 true 的文 »
Blast2GO 本地化 2020-07-24 | bioinformation | 准备 Linux版本信息 1 2 #> cat /etc/redhat-release CentOS Linux release 7.7.1908 (Core) mysql 如果你从未使用过mysql 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 # 下载源 #> wget http://repo.mysql.com/mysql-community-release-el7-5.noarch.rpm # 安装源 »
PBS作业投递系统使用 2020-06-01 | Others | 系统架构 计算节点共有5台曙光I840-G30四路服务器。每台服务器配置4颗20核Intel Xeon 6248 2.5GHz处理器,1536G DDR4内存。 G »
CAZy数据库简介 2018-02-06 | bioinformation | 碳水化合物活性酶数据库(CAZy) 提供了酶分子序列的家族信息,物种来源,基因序列,蛋白序列,三维结构,EC分类,相关数据库链接…… 建立此数据 »
GTF/GFF文件的差异及其相互转换 2016-09-08 | bioinformation | 我们在做生物分析的时候,经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字,甚至连内容都极为相似~那么,他们究竟差在哪里 »