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CAZy数据库简介

2018-02-06   |   bioinformation     |  

http://www.cazy.org/

碳水化合物活性酶数据库(CAZy)

提供了酶分子序列的家族信息,物种来源,基因序列,蛋白序列,三维结构,EC分类,相关数据库链接…… 建立此数据库是为了将酶分子的序列、结构、催化机制相关联~

分类

通过序列相似性进行家族分类,在这6个大的分类下可继续分为更为细致的亚类。

名称 缩写
糖苷水解酶类 GHs
糖苷转移酶类 GTs
多糖裂解酶类 PLs
糖水化合物脂酶类 CEs
碳水化合物结合模块 CBMs
辅助模块酶类 AAs

名称说明

CAZy名称说明

使用

CAZy的官网只提供了web查找的方法,如果需要本地化,需要自行爬取数据或者使用dbCAN的数据.

下载数据的说明

#数据库# #CAZy#
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GTF/GFF文件的差异及其相互转换
Ming Jia

Ming Jia

BioInformation Analyst

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