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PBS作业投递系统使用

2020-06-01   |   Others     |  

系统架构

系统架构

  • 计算节点共有5台曙光I840-G30四路服务器。每台服务器配置4颗20核Intel Xeon 6248 2.5GHz处理器,1536G DDR4内存。
  • GPU计算节点为1台曙光X745-G30双路服务器。配置2颗20核Intel Xeon 6230 2.1GHz处理器,256G DDR3内存,4张GeForce RTX 2080 Ti显卡。
  • 存储系统采用lustre文件系统,使用一台曙光I620-G30作为元数据服务器,两台曙光S640-G30作为数据服务器,系统提供260T可用空间,为集群系统提供高效、稳定读写性能和存储资源的灵活快速的部署能力。
  • 系统配置管理节点1台,型号为曙光I620-G30双路服务器,部署曙光Gridview 4.0集群管理系统。用户可通过IP地址实现Web访问。
  • 系统配置登录节点1台,型号为曙光I620-G30双路服务器,用户可从内网直接登录该节点实现作业提交、编译程序等。
  • 系统配置1套互联的万兆光纤以太网作为管理网络,配置1套100Gb Infiniband高速网络作为计算网路。
  • 硬件整体架构采用冗余设备或部件,保证设备、部件、链路的高可用性及数据读写、传输的稳定可靠进。

作业调度常用命令

获取所有的节点信息(qhost)

/opt/gridview/pbs/dispatcher/bin/lsf_cmd/listhosts

节点信息

获取所有队列信息(qqueue)

/opt/gridview/pbs/dispatcher/bin/lsf_cmd/listqueues

队列信息

获取所有任务信息(qa)

/opt/gridview/pbs/dispatcher/bin/lsf_cmd/listjobs

所有任务信息

获取我的任务信息(qs)

/opt/gridview/pbs/dispatcher/bin/qstat

用户任务信息

任务投递(qsub)

/opt/gridview/pbs/dispatcher/bin/qsub

1
2
3
4
# 投递任务到指定节点
qsub -l nodes=node3 t.sh
# 投递任务到指定队列
qsub -q middle t.sh

常用目录

管理员软件安装目录

/public/software/

我的软件安装目录

/public/home/guest/softwares

PBS安装目录

/opt/gridview/pbs/dispatcher/bin

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